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特异性引物助力肠道中乳酸菌生物多样性研究

时间:2018-09-25 10:30来源:本站 作者:bio149发布 浏览次数:
    人肠道中含有丰富的乳酸菌(Lactic Acid Bacteria,LAB),对人体具有重要意义。但在粪便中的存在部分低丰度乳酸菌物种,一般测序深度很难捕获乳酸菌的生物多样性。

    针对这一瓶颈,内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室比较分析了443个乳酸菌模式菌株基因序列,设计了可用于肠道中乳酸菌高通量测序的特异性PCR引物(扩增片段约750 bp)。基于PacBio SMRT测序平台,利用该引物解析肠道中乳酸菌的生物多样性,可有效富集肠道中乳酸菌,使其平均相对含量由原来的1-2%提高到10-13%;同时,发现的乳酸菌种类明显高于普通引物的,展现了肠道中低丰度乳酸菌物种的多样性。

    该研究“Design of primers for evaluation of lactic acidbacteria populations in complex biological samples”于2018年8月31日发表在Frontier in Microbiology(9: 2045,doi.org/10.3389/fmicb.2018.02045)杂志,受到相关领域研究人员认可,并入选热心肠先生公众号推送文章之一。


原文链接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2018.02045/full




 
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